Mikrowellen können unabgeschirmte Elektronik oder Empfänger zerstören. Die Hülle von Raketen (Stahl, Alu, etc.) können sie nicht durchdringen, daher wird es auch nix mit "fry electronics" solange keine Antennen benötigt werden. Auch gibt es Probleme mit Nebel und so. Also nicht das gelbe vom Ei. Laser-Waffen sind da besser, müssen sich aber auch durch die Hülle der Rakete schmelzen.
https://www.heise.de/tp/features/Wie-gefaehrlich-ist-die-Mikrowellenwaffe-ADS-3407910.html
https://en.wikipedia.org/wiki/Directed-energy_weapon#Microwave