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  • Winter.mute

10 Beiträge seit 17.07.2015

Re: ... zum Mechanismus

Etwas viel Halbwissen. Manche Dinge stimmen, andere nicht.

Die Krebstherapie soll so funktionieren, dass man dem Körper für die jeweilige krebsart typische Antigene (d.h. Strukturmerkmale welche von Antikörpern erkannt werden) präsentiert und seine Immunantwort dadurch aktiviert. Das ganze geht in Richtung personalisierte Medizin. Man hat Krebsart X mit Mutation Y --> Ok, versuchen wir Antigen Z.

Die Ausführungen zur RNA Synthese sind grober Unfug. RNA wird nicht per PCR synthetisiert und auch nicht per E. coli. PCR ist für die DNA Synthese. Welchen Grund hätten sie denn den zweiten Strang zu synthetisieren?
E. coli ist für DNA Synthese von Plasmiden (oder größeren Konstrukten) oder von rekombinanten Proteinen. Wie würden sie denn ihre mRNA von anderen mRNAs trennen? Und wie bekommen sie die nicht natürlichen Nukleotide integriert?

RNA wird zum einen analog zur Sanger Synthese chemisch synthetisiert:
An eine Oberfläche wird ein Nukleotid (eher Nucleosid) kovalent befestigt. Ein neues Nukleotid mit einer kompatiblen Gruppe wird via "Click Chemie" an das erste Nukleotid kovalent gebunden; unter Abspaltung der Gruppe. Danach wird gewaschen und das nächste Nukleotid (von x Tausend) ist drann. Durch Robotik und clevere Wahl kompatibler Gruppen funktioniert das gut mit niedriger Fehlerrate.

Die zweite Möglichkeit zur effizienten RNA Synthese ist biologisch mit Enzymen. Man benötigt hier eine einzelsträngige DNA als Matrix, die abgelesen wird. Über die RNA Polymerase wird dann RNA synthetisiert. Langweilig isothermal im Thermocycler. Wenn Sie mir nicht glauben googlen Sie einfach das HiScribe T7 RNA Synthese Kit von NEB und lesen sich das Manual durch.

Wo Sie jedoch komplett ins Schwarze getroffen haben ist die Erkenntnis, dass Variante A dazu reicht Probanden einer Studie zu versorgen und keine DNA Verunreinigungen hat. Während Variante B DNA Verunreinigungen aufweißt (eventuell sogar Fragmente der E.Coli Plasmide, aus denen die einzelstränige Matrix hergestellt worden ist), aber günstig genug ist um die Welt damit zu versorgen. Nebenwirkungen durch Fremd-DNA würden dann nicht in der Studie auftreten. Aber das ist eine andere Sache, für die sich sowieso niemand interessiert.

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