Ist vollkommen haltlose Spekulation.
Die Gene für Haar- und Hautfarbe schalten bloß die Intensität der Pigmentproduktion hoch und runter, diese Regelkreise gibt es schon bei den afrikanischen Populationen. Und wenn man sich dort umschaut, ist die Pigmentierung schon innerhalb von Afrika höchst variable, da sind Neandertalergene völlig unnötig zur Erklärung.
Ich vermute, die Funktion der Neandertalergene ist bisher schlicht unerforscht, sonst hätte man darüber schon was gelesen.