Eine Möglichkeit, diese beiden Begriffe zu trennen, wäre vielleicht, wenn man Naturalismus als den Versuch sieht, die gesamte Welt wie ein Diorama vor sich hinstellen zu können, mit Figuren von Menschen, Tieren und allen möglichen Dingen, und mit dem Anspruch, von allen diesen Figürchen zumindest theoretisch sagen zu können, nach welchen Gesetzen sie aufgebaut sind, funktionieren und miteinander interagieren.
Physikalismus dagegen kann auch eine Sicht einschließen, bei der es immer einen nicht in anderes auflösbaren Beobachter geben muss, der die für ihn möglichen Eigenschaften und Beziehungen der ihm sichtbaren Welt für sich bündelt.